A tészta hozzávalóit összegyúrjuk, és hagyjuk pihenni, amíg a tölteléket elkészítjük. A töltelék összetevőit egy tálban összekeverjük, ügyelve arra, hogy a bacon vagy a kolbász miatt ne legyen túl sós a keverék.

A tésztából egy kisebb darabot letépünk, majd kinyújtjuk. A közepére egy kanál tölteléket teszünk, és a tészta széleit batyu formában összehajtjuk. Ezután a nyújtófa és a kezünk segítségével ovális vagy kör alakúra formázzuk. Az összes pupusas így készül el.

Egy száraz serpenyőben, olaj nélkül, a legkisebb lángon sütjük őket 2-4 percig mindkét oldalukon, amíg szép világosbarnára pirulnak.

Ebből az adagból körülbelül 10-12 darab pupusas készül.